Возобновившиеся в 1659 г. военные действия развивались неблагоприятно для русских войск, оставивших Минск, Борисов и Могилев. На Украине русское войско потерпело поражение от польско-крымских сил под Чудновом. Вскоре, однако, продвижение поляков было приостановлено. Началась затяжная война, изматывавшая силы обеих сторон.

Между тем вызванное войной напряжение обострило внутриполитическую обстановку как в России, так и в Речи Посполитой. В России вспыхнул «медный бунт», в Речи Посполитой возникло оппозиционное движение магнатов и шляхты, недовольных политикой Яна Казимира. Истощенные противники закончили длительную войну в 1667 г. Андрусовским перемирием сроком на 13 с половиной лет.

Переговоры в Андрусове (близ Смоленска) вел выдающийся дипломат, начальник Посольского приказа Афанасий Лаврентьевич Ордин-Нащокин, получивший звание «царственной большой печати и государственных великих посольских дел сберегателя». По достигнутому соглашению Россия удержала за собой Смоленск с окружающей его территорией и Левобережную Украину. Город Киев на правом берегу Днепра был передан во владение России на два года; Белоруссия и Право-бережная Украина остались под властью Речи Посполитой.

Андрусовское перемирие 1667 г. не разрешило сложных вопросов, стоявших перед Россией. Украина оказалась разделенной на две части. Левобережная ее часть вместе с Киевом, воссоединенная с Россией, получила возможность экономического и культурного развития. Правобережная Украина испытала все ужасы крымско-татарских нашествий и осталась под властью польских панов.

Швеция по Кардисскому миру удержала в своем владении русское побережье Финского залива, единственное значение которого для Швеции заключалось только в том, что Россия, крупнейшая страна Европы, лишалась прямого выхода к Балтийскому морю. Тем самым создавалась постоянная угроза возникновения нового военного конфликта между Россией и Швецией.

Неразрешенным остался и вопрос об отношениях России с Крымским ханством и Турцией. Азов остался турецкой крепостью, а крымские орды продолжали совершать нападения на южные окраины России.